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Enregistrement W2011754595 · doi:10.3899/jrheum.081093

The Association with the −159C/T Polymorphism in the Promoter Region of the CD14 Gene and Juvenile Idiopathic Arthritis in a Chinese Han Population

2009· article· en· W2011754595 sur OpenAlexvenueno aff
Hua Zeng, XIANG YUAN CHEN, Xiao Luo

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutoimmune and Inflammatory Disorders Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypeMedicineAlleleInternal medicineArthritisGastroenterologyRestriction fragment length polymorphismGenotype frequencyAllele frequencyPolymorphism (computer science)GeneticsGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Juvenile idiopathic arthritis (JIA) is generally considered to be caused by interaction of genetic and environmental factors. We investigated the association of a C-to-T transition in the promoter region of the CD14 gene on chromosome 5q31.1 and JIA in a Chinese Han population. METHODS: One hundred sixty-three children with JIA and 281 healthy children (age- and sex-matched to JIA group) were studied. Polymerase chain reaction-restriction fragment-length polymorphism (PCR-RFLP) was used for analysis of the genotypes. (Trial registration number ChiCTR-CCC-00000312.) RESULTS: CD14 promoter-159 genotype frequencies of CC, CT, and TT were 11.48%, 49.18%, and 39.34%, respectively, in the systemic onset JIA group; 21.62%, 43.24%, and 35.14%, in the polyarticular JIA group; 16.67%, 50%, and 33.33%, in the oligoarticular JIA group; 6.9%, 75.86%, and 17.24%, in the group with other types of JIA; and 37.01%, 46.98%, and 16.01%, in the control group. Genotype frequency and allele frequency distribution were in accord with Hardy-Weinberg equilibrium. There were statistically significant differences in frequencies of genotype and allele in CD14 C-159T polymorphism between JIA group and control group (genotype: chi-squared = 33.168, p < 0.05, CT vs CC, OR 2.946, 95% CI 1.739-4.990; TT vs CC, OR 5.426, 95% CI 2.977-9.891. Allele: chi-squared = 33.168, p < 0.05, T vs C, OR 2.251, 95% CI 1.704-2.973). The T allele frequencies of boys and girls were significantly higher than those in the control group (p < 0.001 of both). CONCLUSION: CD14 gene promoter C-159T polymorphism is significantly correlated with JIA in the Chinese Han population. The T allele of the C-159T polymorphism of CD14 gene may be a genetic risk factor for JIA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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