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Enregistrement W2011754595 · doi:10.3899/jrheum.081093

The Association with the −159C/T Polymorphism in the Promoter Region of the CD14 Gene and Juvenile Idiopathic Arthritis in a Chinese Han Population

2009· article· en· W2011754595 sur OpenAlexvenueno aff
Hua Zeng, XIANG YUAN CHEN, Xiao Luo

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutoimmune and Inflammatory Disorders Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypeMedicineAlleleInternal medicineArthritisGastroenterologyRestriction fragment length polymorphismGenotype frequencyAllele frequencyPolymorphism (computer science)GeneticsGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Juvenile idiopathic arthritis (JIA) is generally considered to be caused by interaction of genetic and environmental factors. We investigated the association of a C-to-T transition in the promoter region of the CD14 gene on chromosome 5q31.1 and JIA in a Chinese Han population. METHODS: One hundred sixty-three children with JIA and 281 healthy children (age- and sex-matched to JIA group) were studied. Polymerase chain reaction-restriction fragment-length polymorphism (PCR-RFLP) was used for analysis of the genotypes. (Trial registration number ChiCTR-CCC-00000312.) RESULTS: CD14 promoter-159 genotype frequencies of CC, CT, and TT were 11.48%, 49.18%, and 39.34%, respectively, in the systemic onset JIA group; 21.62%, 43.24%, and 35.14%, in the polyarticular JIA group; 16.67%, 50%, and 33.33%, in the oligoarticular JIA group; 6.9%, 75.86%, and 17.24%, in the group with other types of JIA; and 37.01%, 46.98%, and 16.01%, in the control group. Genotype frequency and allele frequency distribution were in accord with Hardy-Weinberg equilibrium. There were statistically significant differences in frequencies of genotype and allele in CD14 C-159T polymorphism between JIA group and control group (genotype: chi-squared = 33.168, p < 0.05, CT vs CC, OR 2.946, 95% CI 1.739-4.990; TT vs CC, OR 5.426, 95% CI 2.977-9.891. Allele: chi-squared = 33.168, p < 0.05, T vs C, OR 2.251, 95% CI 1.704-2.973). The T allele frequencies of boys and girls were significantly higher than those in the control group (p < 0.001 of both). CONCLUSION: CD14 gene promoter C-159T polymorphism is significantly correlated with JIA in the Chinese Han population. The T allele of the C-159T polymorphism of CD14 gene may be a genetic risk factor for JIA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,067
Score d'incertitude au seuil0,285

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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