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Enregistrement W2011850797 · doi:10.1371/journal.pone.0015662

TBC-2 Is Required for Embryonic Yolk Protein Storage and Larval Survival during L1 Diapause in Caenorhabditis elegans

2010· article· en· W2011850797 sur OpenAlexafffund
Laëtitia Chotard, Olga Skorobogata, Marc-André Sylvain, Sanhita Shrivastava, Christian E. Rocheleau

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensRoyal Victoria HospitalRoyal Victoria Regional Health CentreMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University Health CentreNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésCaenorhabditis elegansBiologyYolkCell biologyRabMutantGreen fluorescent proteinDiapauseZebrafishEmbryoGTPaseBiochemistryLarvaGeneBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

C. elegans first stage (L1) larvae hatched in the absence of food, arrest development and enter an L1 diapause, whereby they can survive starvation for several weeks. The physiological and metabolic requirements for survival during L1 diapause are poorly understood. However, yolk, a cholesterol binding/transport protein, has been suggested to serve as an energy source. Here, we demonstrate that C. elegans TBC-2, a RAB-5 GTPase Activating Protein (GAP) involved in early-to-late endosome transition, is important for yolk protein storage during embryogenesis and for L1 survival during starvation. We found during embryogenesis, that a yolk::green fluorescent protein fusion (YP170::GFP), disappeared much more quickly in tbc-2 mutant embryos as compared with wild-type control embryos. The premature disappearance of YP170::GFP in tbc-2 mutants is likely due to premature degradation in the lysosomes as we found that YP170::GFP showed increased colocalization with Lysotracker Red, a marker for acidic compartments. Furthermore, YP170::GFP disappearance in tbc-2 mutants required RAB-7, a regulator of endosome to lysosome trafficking. Although tbc-2 is not essential in fed animals, we discovered that tbc-2 mutant L1 larvae have strongly reduced survival when hatched in the absence of food. We show that tbc-2 mutant larvae are not defective in maintaining L1 diapause and that mutants defective in yolk uptake, rme-1 and rme-6, also had strongly reduced L1 survival when hatched in the absence of food. Our findings demonstrate that TBC-2 is required for yolk protein storage during embryonic development and provide strong correlative data indicating that yolk constitutes an important energy source for larval survival during L1 diapause.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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