TBC-2 Is Required for Embryonic Yolk Protein Storage and Larval Survival during L1 Diapause in Caenorhabditis elegans
Notice bibliographique
Résumé
C. elegans first stage (L1) larvae hatched in the absence of food, arrest development and enter an L1 diapause, whereby they can survive starvation for several weeks. The physiological and metabolic requirements for survival during L1 diapause are poorly understood. However, yolk, a cholesterol binding/transport protein, has been suggested to serve as an energy source. Here, we demonstrate that C. elegans TBC-2, a RAB-5 GTPase Activating Protein (GAP) involved in early-to-late endosome transition, is important for yolk protein storage during embryogenesis and for L1 survival during starvation. We found during embryogenesis, that a yolk::green fluorescent protein fusion (YP170::GFP), disappeared much more quickly in tbc-2 mutant embryos as compared with wild-type control embryos. The premature disappearance of YP170::GFP in tbc-2 mutants is likely due to premature degradation in the lysosomes as we found that YP170::GFP showed increased colocalization with Lysotracker Red, a marker for acidic compartments. Furthermore, YP170::GFP disappearance in tbc-2 mutants required RAB-7, a regulator of endosome to lysosome trafficking. Although tbc-2 is not essential in fed animals, we discovered that tbc-2 mutant L1 larvae have strongly reduced survival when hatched in the absence of food. We show that tbc-2 mutant larvae are not defective in maintaining L1 diapause and that mutants defective in yolk uptake, rme-1 and rme-6, also had strongly reduced L1 survival when hatched in the absence of food. Our findings demonstrate that TBC-2 is required for yolk protein storage during embryonic development and provide strong correlative data indicating that yolk constitutes an important energy source for larval survival during L1 diapause.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».