Fungal Cultures in Patients with Allergic Fungal Rhinosinusitis: Improving the Recovery of Potential Fungal Pathogens in the Canadian Laboratory
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: There is no uniform consensus on how to grow fungi from sinus aspirates in the Canadian setting. Protocols vary between institutions, and the positivity rate for fungal cultures ranges between 10 and 20% even when endoscopically obvious allergic mucin is being sent to the laboratory. The aim of this study was to compare the occurrence of positive fungal cultures obtained by our institution's fungal culture method with the occurrence obtained by the Mayo Clinic's fungal culture method. The ultimate aim was to propose a modified, feasible, standardized protocol for culturing fungi from sinus aspirates in the Canadian laboratory setting. METHODS: Twenty-five allergic mucin aspirates were collected in 23 consecutive patients meeting the clinical diagnosis of allergic fungal rhinosinusitis. These samples were sent to the microbiology laboratory, where half of them were subject to our conventional laboratory protocol and the other half to the modified Mayo Clinic protocol. RESULTS: Positive fungal cultures were obtained in 16 of 25 (64%) specimens when the modified Mayo Clinic culture technique was used, with 12 cultures (48%) growing pathogenic fungus. Using our standard culture technique, 4 of 25 (16%) specimens resulted in a positive fungal culture, of which 3 grew pathogenic fungus (12%). A significantly greater fungal culture yield was obtained by the modified Mayo Clinic fungal culture technique than with our culturing technique. CONCLUSION: The modified Mayo Clinic fungal culture technique, although more costly, is a highly sensitive and effective technique for growing fungi from nasal specimens when compared with our traditional culture technique.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».