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The thermolabile variant 677C?T can further reduce activity when expressed in CIS with severe mutations for human methylenetetrahydrofolate reductase

2000· article· en· W2012073172 sur OpenAlexaff
Philippe Goyette, Rima Rozen

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThermolabileMethylenetetrahydrofolate reductaseMissense mutationBiologyAlleleHyperhomocysteinemiaReductaseMutationMethionineHomocysteineGeneticsEndocrinologyInternal medicineEnzymeGeneMedicineBiochemistryAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) catalyses the reduction of 5,10-methylenetetrahydrofolate to 5-methyltetrahydrofolate, a carbon donor for homocysteine remethylation to methionine. Severe MTHFR deficiency is associated with hyperhomocysteinemia and homocystinuria. These patients show a wide variety of neurological and vascular symptoms, with variable age of onset. Residual enzyme activity is usually less than 20% of control values, and correlates reasonably well with age of onset of symptoms. A milder deficiency of MTHFR, with 30%-50% residual enzyme activity and increased enzyme thermolability, has been described as a risk factor for vascular disease and for neural tube defects. In earlier work, we isolated the human cDNA for MTHFR, and reported 14 mutations in severe MTHFR deficiency, as well as a common 677C-->T missense mutation (Ala-->Val) that encodes the thermolabile MTHFR. This variant has also been observed in some patients with severe MTHFR deficiency, in cis with their severe mutations. We report here the in vitro expression of seven severe MTHFR mutations in a bacterial expression system; six of these were expressed in cis with the Val allele to mimic the situation in the patients. We show that three of these constructs have significantly reduced enzyme activity (<10% of control); the presence of the thermolabile variant in these patients in cis is unlikely to affect enzyme function since activity is already low. One mutation causes a dramatic increase in activity when it is expressed in cis with the Ala allele, but is associated with extreme lability when in cis with the Val allele. Three mutations cause moderate decreases in enzyme activity, with a further decrease in activity when they are in cis with the Val allele. We hypothesize that deleterious mutations which alter stability may be compromised to a greater degree when the thermolabile variant is present on the same allele.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,285
Score d'incertitude au seuil0,664

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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