Elucidation of Fragmentation Mechanisms of Protonated Peptide Ions and Their Products: A Case Study on Glycylglycylglycine Using Density Functional Theory and Threshold Collision-Induced Dissociation
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The fragmentation mechanisms of protonated triglycine and its first-generation dissociation products have been investigated using a combination of density functional theory calculations and threshold collision-induced dissociation experiments. The activation barrier measured for the fragmentation of protonated triglycine to the b(2) ion and glycine is in good agreement with a calculated barrier at the B3LYP/6-31++G(d,p) level of theory reported earlier [Rodriquez, C. F. et al. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3006-3012]. The b(2) ion fragments to the a(2) ion via a transition state structure that is best described as acylium-like. Contrary to what is commonly assumed, the lowest energy structure of the a(2) ion is not an iminium ion, but a cyclic, protonated 4-imidazolidone. Furthermore, fragmentation of the b(2) to the a(1) ion proceeds not via a mechanism that results in HNCO and H(2)C=C=O as byproducts, as have been postulated, but via a transition state that contains an incipient a(1) ion and an incipient carbene. The fragmentation of a(2) to a(1) proceeds via a transition state structure that contains the a(1) ion, CO and an imine as incipient components.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle