Making Sense out of Antisense Transcription in Human T-Cell Lymphotropic Viruses (HTLVs)
Notice bibliographique
Résumé
Retroviral gene expression generally depends on a full-length transcript that initiates in the 5' long terminal repeat (LTR), which is either unspliced or alternatively spliced. We and others have demonstrated the existence of an antisense transcript initiating in the 3' LTR of the Human T-cell Leukemia Virus type 1 (HTLV-1) that is involved in the production of HBZ (HTLV-1 basic leucine zipper (bZIP) factor). HBZ is a Fos-like factor capable of inhibiting Tax-mediated activation of the HTLV-1 LTR by interacting with the cellular transcription factor cAMP-response element-binding protein (CREB) and the pleiotropic cellular coactivators p300/CBP. HBZ can also activate cellular transcription through its interaction with p300/CBP. Interestingly, HBZ has also been found to promote T-lymphocyte proliferation. By down-regulating viral expression and by stimulating T-cell proliferation, HBZ could be essential in the establishment of a chronic infection. Antisense transcription also occurs in the closely related HTLV-2 retrovirus as well as in the recently discovered HTLV-3 and HTLV-4. These antisense transcripts are also involved in the production of retroviral proteins that we have termed Antisense Protein of HTLVs (APH). Like HBZ, the APH proteins are localized in the nucleus of transfected cells and repress Tax-mediated viral transcription.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».