High Genetic Variability With No Apparent Geographic Structuring in the mtDNA of the Amphidromous River Shrimp Cryphiops caementarius (Decapoda: Palaemonidae) in Northern-Central Chile
Notice bibliographique
Résumé
Freshwater organisms with an amphidromous life cycle are generally thought to disperse widely through marine planktonic larval stages, but only few studies on genetic population structure of amphidromous shrimp exist. We used a 640-basepair region of the mitochondrial gene cytochrome c oxidase I (Cox1) from the amphidromous river shrimp Cryphiops caementarius from five rivers in northern-central Chile to test whether large distances between estuaries (up to 700 km) limit gene flow between populations and result in genetic differentiation among populations. The results revealed high haplotype diversity with no significant geographical structuring, suggesting that gene flow occurs regularly over several hundreds of kilometres, also connecting populations north and south of the Atacama Desert. Seemingly, the terrestrial barrier is overcome by planktonic larval dispersal through the sea, suggesting wide dispersal rather than “stepping-stone” dispersal between estuaries. The population from the southern limit of the geographic distribution of C. caementarius (Río Limari) revealed some weak differentiation in pairwise WST comparisons, but larger sample sizes are necessary to confirm this. Additional studies are needed for a better understanding of factors that promote different life histories, like marine planktonic dispersal, larval retention in estuaries, or an amphidromous-freshwater transition towards a purely freshwater life cycle.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».