MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2012351627 · doi:10.18388/abp.2007_3262

A novel alpha-glucosidase from the moss Scopelophila cataractae.

2007· article· en· W2012351627 sur OpenAlexaff
Yoshiki Yamasaki, Susumu Nakashima, Haruyoshi Konno

Notice bibliographique

RevueActa Biochimica Polonica · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnzyme Production and Characterization
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAmylopectinIsomaltoseMaltoseMaltotrioseChemistryHydrolysisBiochemistryChromatographyIsoelectric pointPullulanAmyloseEnzymeStarchPolysaccharide

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Scopelophila cataractae is a rare moss that grows on copper-containing soils. S. cataractae protonema was grown on basal MS medium containing copper. A starch-degrading activity was detected in homogenates of the protonema, after successive extraction with phosphate buffer and buffer containing 3 M LiCl. Buffer-soluble extract (BS) and LiCl-soluble extract (LS) readily hydrolyzed amylopectin to liberate only glucose, which shows that alpha-glucosidase (EC 3.2.1.20) in BS and LS hydrolyzed amylopectin. The K(m) value of BS for maltose was 0.427. The K(m) value of BS for malto-oligosaccharide decreased with an increase in the molecular mass of the substrate. The value for maltohexaose was 0.106, which is about four-fold lower than that for maltose. BS was divided into two fractions of alpha-glucosidase (BS-1 and BS-2) by isoelectric focusing. The isoelectric points of these two enzymes were determined to be 4.36 (BS-1) and 5.25 (BS-2) by analytical gel electrofocusing. The two enzymes readily hydrolyzed malto-oligosaccharides. The two enzymes also hydrolyzed amylose, amylopectin and soluble starch at a rate similar to that with maltose. The two enzymes readily hydrolyzed panose to liberate glucose and maltose (1 : 1), and the K(m) value of BS for panose was similar to that for maltotriose, whereas the enzymes hydrolyzed isomaltose only weakly. With regard to substrate specificity, the two enzymes in BS are novel alpha-glucosidases. The two enzymes also hydrolyzed beta-limit dextrin, which has many alpha-1,6-glucosidic linkages near the non-reducing ends, more strongly than maltose, which shows that they do not need a debranching enzyme for starch digestion. The starch-degrading activity of BS was not inhibited by p-chloromercuribenzoic acid or alpha-amylase inhibitor. When amylopectin was treated with BS and LS in phosphate buffer, pH 6.0, glucose, but not glucose-1-phosphate, was detected, showing that the extracts did not contain phosphorylase but did contain an alpha-glucosidase. These results show that alpha-glucosidases should be capable of complete starch digestion by themselves in cells of S. cataractae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,270
Score d'incertitude au seuil0,584

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueActa Biochimica PolonicaMême sujetEnzyme Production and CharacterizationTravaux en français237 207