The Molecular Basis for Cyclopiazonic Acid Inhibition of the Sarcoplasmic Reticulum Calcium Pump
Notice bibliographique
Résumé
The sarcoplasmic reticulum Ca(2+)-ATPase is essential for calcium reuptake in the muscle contraction-relaxation cycle. Here we present structures of a calcium-free state with bound cyclopiazonic acid (CPA) and magnesium fluoride at 2.65 A resolution and a calcium-free state with bound CPA and ADP at 3.4A resolution. In both structures, CPA occupies the calcium access channel delimited by transmembrane segments M1-M4. Inhibition of Ca(2+)-ATPase is stabilized by a polar pocket that surrounds the tetramic acid of CPA and a hydrophobic platform that cradles the inhibitor. The calcium pump residues involved include Gln(56), Leu(61), Val(62), and Asn(101). We conclude that CPA inhibits the calcium pump by blocking the calcium access channel and immobilizing a subset of transmembrane helices. In the E2(CPA) structure, ADP is bound in a distinct orientation within the nucleotide binding pocket. The adenine ring is sandwiched between Arg(489) of the nucleotide-binding domain and Arg(678) of the phosphorylation domain. This mode of binding conforms to an adenine recognition motif commonly found in ATP-dependent proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».