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Enregistrement W2012506110 · doi:10.1242/dev.01096

The <i>HALTED ROOT</i> gene encoding the 26S proteasome subunit RPT2a is essential for the maintenance of <i>Arabidopsis</i> meristems

2004· article· en· W2012506110 sur OpenAlexfundno aff
Minako Ueda, Keisuke Matsui, Sumie Ishiguro, Ryosuke Sano, Takuji Wada, Ivan A. Paponov, Klaus Palme, Kiyotaka Okada

Notice bibliographique

RevueDevelopment · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyArizona Biomedical Research CommissionDeutsche ForschungsgemeinschaftYork UniversityJapan Science and Technology AgencyOhio State University
Mots-clésBiologyArabidopsisMeristemProteasomeGeneProtein subunitGeneticsCell biologyComputational biologyMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In higher plants, post-embryonic development is dependent on the activity of the root and shoot apical meristem (RAM and SAM). The quiescent center (QC) in the RAM and the organizing center (OC) in the SAM are known to be essential for the maintenance of meristematic activity. To understand the mechanism that maintains post-embryonic meristems, we isolated an Arabidopsis mutant, halted root (hlr). In this mutant, the cellular organization was disrupted in post-embryonic meristems both in the root and in the shoot, and their meristematic activity was reduced or became abnormal. We showed that the mutant RAM lost its QC identity after germination, which was specified during embryogenesis, whereas the identity of differentiated tissues was maintained. In the post-embryonic SAM, the expression pattern of a typical OC marker gene, WUSCHEL, was disturbed in the mutant. These observations indicate that the HLR gene is essential to maintain the cellular organization and normal nature of the RAM and SAM. The HLR gene encodes RPT2a, which is a subunit of the 26S proteasome that degrades key proteins in diverse cellular processes. We showed that the HLR gene was expressed both in the RAM and in the SAM, including in the QC and the OC, respectively, and that the activity of proteasomes were reduced in the mutant. We propose that proteasome-dependent programmed proteolysis is required to maintain the meristem integrity both in the shoot and in the root.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,366
Score d'incertitude au seuil0,742

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations96
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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