MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2012561847 · doi:10.1074/jbc.m610978200

HCN2 and HCN4 Isoforms Self-assemble and Co-assemble with Equal Preference to Form Functional Pacemaker Channels

2007· article· en· W2012561847 sur OpenAlexaff
Gina M. Whitaker, Damiano Angoli, Hamed Nazzari, Ryuichi Shigemoto, Eric A. Accili

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésColocalizationHCN channelGene isoformIon channelBiologyHyperpolarization (physics)Cell biologyElectrophysiologyChinese hamster ovary cellBiophysicsChemistryNeuroscienceBiochemistryGeneReceptorStereochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-modulated (HCN) "pacemaker" channel subunits are integral membrane proteins that assemble as tetramers to form channels in cardiac conduction tissue and nerve cells. Previous studies have suggested that the HCN2 and HCN4 channel isoforms physically interact when overexpressed in mammalian cells, but whether they are able to co-assemble and form functional channels remains unclear. The extent to which co-assembly occurs over self-assembly and whether HCN2-HCN4 heteromeric channels are formed in native tissue are not known. In this study, we show co-assembly of HCN2 and HCN4 in live Chinese hamster ovary cells using bioluminescence resonance energy transfer (BRET(2)), a novel approach for studying tetramerization of ion channel subunits. Together with results from electrophysiological and imaging approaches, the BRET(2) data show that HCN2 and HCN4 subunits self-assemble and co-assemble with equal preference. We also demonstrate colocalization of HCN2 and HCN4 and a positive correlation of their intensities in the embryonic mouse heart using immunohistochemistry, as well as physical interactions between these isoforms in the rat thalamus by coimmunoprecipitation. Together, these data support the formation of HCN2-HCN4 heteromeric channels in native tissue.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,409

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetIon channel regulation and functionTravaux en français237 207