Mitochondrial DNA variation in cultivated and wild potato species (<i>Solanum</i>spp.)Contribution No. 87 from the Institute of Plant Genetics, Research Division of Portici.
Notice bibliographique
Résumé
The European cultivated potato, Solanum tuberosum subsp. tuberosum, has 6 related cultivated species and more than 200 wild relatives. In Solanum spp., studies of cytoplasmic organelles have been mainly confined to the plastid DNA composition of cultivated and wild species. In this study, 53 genotypes of 30 potato species belonging to the subsections Estolonifera and Potatoe, 2 tomato species, and a black nightshade genotype were examined using PCR markers to evaluate mitochondrial DNA diversity and assess whether mtDNA variability was correlated with series classification, geographical origin, ploidy, and endosperm balance number (EBN). The markers used revealed interspecific mtDNA variability in Solanum spp. and identified 13 different haplotypes. Intraspecific variability was also observed in a few species and genomic regions. Cluster analysis allowed arrangement of the 13 haplotypes into 7 subgroups, and statistical association tests showed significant relationships between mitochondrial patterns detected by molecular analysis and ploidy, EBN, and geographical origin. On the whole, the evolutionary patterns for the genomic regions analyzed reflected the species relationships established on the basis of morphological and molecular (nuclear and plastidial DNA) data. The mtDNA variability shown is also important for better characterization of genetic resources for potato breeding.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».