DNA Barcoding Reveals Cryptic Diversity in Lumbricus terrestris L., 1758 (Clitellata): Resurrection of L. herculeus (Savigny, 1826)
Notice bibliographique
Résumé
The widely studied and invasive earthworm, Lumbricus terrestris L., 1758 has been the subject of nomenclatural debate for many years. However these disputes were not based on suspicions of heterogeneity, but rather on the descriptions and nomenclatural acts associated with the species name. Large numbers of DNA barcode sequences of the cytochrome oxidase I obtained for nominal L. terrestris and six congeneric species reveal that there are two distinct lineages within nominal L. terrestris. One of those lineages contains the Swedish population from which the name-bearing specimen of L. terrestris was obtained. The other contains the population from which the syntype series of Enterion herculeum Savigny, 1826 was collected. In both cases modern and old representatives yielded barcode sequences allowing us to clearly establish that these are two distinct species, as different from one another as any other pair of congeners in our data set. The two are morphologically indistinguishable, except by overlapping size-related characters. We have designated a new neotype for L. terrestris. The newly designated neotype and a syntype of L. herculeus yielded DNA adequate for sequencing part of the cytochrome oxidase I gene (COI). The sequence data make possible the objective determination of the identities of earthworms morphologically identical to L. terrestris and L. herculeus, regardless of body size and segment number. Past work on nominal L. terrestris could have been on either or both species, although L. herculeus has yet to be found outside of Europe.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».