Comparison of Cytokine mRNA Expression in the Bronchoalveolar Lavage Fluid of Horses with Inflammatory Airway Disease and Bronchoalveolar Lavage Mastocytosis or Neutrophilia Using REST Software Analysis
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: The pathophysiology of inflammatory airway disease (IAD) is unknown, but in some cases involves the accumulation of mast cells, neutrophils, or both in the bronchoalveolar lavage fluid (BALF). The objective of this study was to characterize cytokine gene expression in the BALF cells of horses with IAD, including a comparison of cytokine gene expression between IAD horses with increased BALF mast cells (IAD-Mast) or neutrophils (IAD-Neutro). METHODS: The mRNA expression of IL-4, IFN-γ, IL-17, IL-8, IL-1β, IL-5, IL-6, IL-10, IL-12p35, and eotaxin-2 was studied by quantitative polymerase chain reaction (QPCR) with efficiency correction in BALF samples of 17 horses with IAD (IAD-total), also subcategorized as 8 IAD-Mast and 9 IAD-Neutro, and 10 controls. Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) was used as a reference gene. Relative expression software tool (REST) analysis provided ratios of expression, statistical analysis, and confidence intervals for the results. RESULTS: Compared with the control group, IL-5, IL-1β, IL-6, IL-8, and IL-10 mRNA expression was upregulated 3.5-, 3.4-, 2.8-, 2.2-, and 1.9-fold, respectively, in the IAD-total group. The IAD-Neutro group showed increased expression of IL-17, IL-8, and IL-5 (4.7-, 2.5-, and 2.9-fold, respectively) and a decreased expression of IL-4 (3.4-fold) compared with the IAD-Mast group. CONCLUSION: Cytokines from the Th2 family plays a key role in IAD and a different pathophysiology may be involved in mast cell versus neutrophil BALF accumulation in IAD horses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».