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Enregistrement W2012988203 · doi:10.1139/g04-046

A major suppressor of cell death,<i>slm1</i>, modifies the expression of the maize (<i>Zea mays</i>L.) lesion mimic mutation<i>les23</i>

2004· article· en· W2012988203 sur OpenAlexvenueno aff
Bryan W. Penning, Gurmukh S. Johal, Michael D. McMullen

Notice bibliographique

RevueGenome · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of MissouriPurdue University
Mots-clésQuantitative trait locusBiologyLesionPhenotypeLocus (genetics)GeneticsAllelePopulationLoss functionGenePathologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Disease lesion mimics provide an excellent biological system to study the genetic basis of cell death in plants. Many lesion mimics show variation in phenotype expression in different genetic backgrounds. Our goal was to identify quantitative trait loci (QTL) modifying lesion mimic expression thereby identifying genetic modifiers of cell death. A recessive lesion mimic, les23, in a severe-expressing line was crossed to the maize inbred line Mo20W, a lesion-suppressing line, and an F(2) population was developed for QTL analysis. In addition to locating les23 to the short arm of chromosome 2, this analysis detected significant loci for modification of lesion expression. One highly significant locus was found on the long arm of chromosome 2. The Mo20W allele at this QTL significantly delayed initiation of the lesion phenotype and decreased the final lesion severity. Other QTL with lesser effect affected severity of lesion expression without affecting lesion initiation date. Our results demonstrate that dramatic change in lesion phenotype can be controlled by a single major QTL. The presumed function of this QTL in normal plants is to regulate some aspect of the cell death pathway underlying the les23 phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,304

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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