MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2013002982 · doi:10.1073/pnas.092515799

Solution structures of the cytoplasmic tail complex from platelet integrin αIIb- and β3-subunits

2002· article· en· W2013002982 sur OpenAlex
Aalim M. Weljie, Peter M. Hwang, Hans J. Vogel

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensCanada Research ChairsUniversity of TorontoUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Heritage Foundation for Medical ResearchFondation pour la Recherche MédicaleUniversity of AlbertaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésIntegrinSalt bridgeProtein subunitCytoplasmConformational isomerismDimerCys-loop receptorsChemistryBiophysicsPlatelet Glycoprotein GPIIb-IIIa ComplexStructural motifCD49cStereochemistryBiochemistryBiologyCollagen receptorReceptorMoleculeMutantGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Integrin adhesion receptors constitute a cell-signaling system whereby interactions in the small cytoplasmic domains of the heterodimeric alpha- and beta-subunits provoke major functional alterations in the large extracellular domains. With two-dimensional NMR spectroscopy, we examined two synthetic peptides [alphaIIb((987)MWKVGFFKRNR) and beta3((716)KLLITIHDRKEFAKFEEERARAKWD)] encompassing the membrane-proximal regions of the cytoplasmic domain motifs from the platelet integrin complex alphaIotaIotabbeta3. These membrane-proximal regions contain two conserved motifs, represented by (989)KVGFFKR in the alphaIIb-subunit, and (716)KLLITIHDR in the beta3-subunit. The dimer interaction consists of two adjacent helices with residues V990 and F993 of the alphaIotaIotab-subunit heavily implicated in the dimer interfacial region, as is I719 of beta3. These residues are situated within the conserved motifs of their respective proteins. Further structural analysis of this unique peptide heterodimer suggests that two distinct conformers are present. The major structural difference between the two conformers is a bend in the beta3-peptide between D723 and A728, whereas the helical character in the other regions remains intact. Earlier mutational analysis has shown that a salt bridge between the side chains of alphaIotaIotab(R955) and beta3(D723) is formed. When this ion pair was modeled into both conformers, increased nuclear Overhauser effect violations suggested that the more bent structure was less able to accommodate this interaction. These results provide a molecular level rationalization for previously reported biochemical studies, as well as a basis for an atomic level understanding of the intermolecular interactions that regulate integrin activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,366
Score d'incertitude au seuil0,487

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle