Dissociable Rpb4-Rpb7 Subassembly of RNA Polymerase II Binds to Single-strand Nucleic Acid and Mediates a Post-recruitment Step in Transcription Initiation
Notice bibliographique
Résumé
The Rpb4 and Rpb7 subunits of yeast RNA polymerase II form a heterodimeric complex essential for promoter-directed transcription initiation in a reconstituted system. Results of template competition experiments indicate that the Rpb4-Rpb7 complex is not required for stable recruitment of polymerase to active preinitiation complexes, suggesting that Rpb4-Rpb7 mediates an essential step subsequent to promoter binding. Sequence and structure-based alignments revealed a possible OB-fold single-strand nucleic acid-binding motif in Rpb7. Purified Rpb4-Rpb7 complex exhibited both single-strand DNA- and RNA-binding activities, and a small deletion in the putative OB-fold nucleic acid-binding surface of Rpb7 abolished binding activity without affecting the stability of the Rpb4-Rpb7 complex or its ability to associate with polymerase. The same mutation destroyed the transcription activity of the Rpb4-Rpb7 complex. A separate deletion elsewhere in the OB-fold motif of Rpb7 also blocked transcription but did not affect nucleic acid binding, suggesting that the OB-fold of Rpb7 mediates both DNA-protein and protein-protein interactions required for productive initiation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».