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Enregistrement W2013041387 · doi:10.1139/g05-054

Molecular characterization and mapping of<i>ALMT1</i>, the aluminium-tolerance gene of bread wheat (<i>Triticum aestivum</i>L.)

2005· article· en· W2013041387 sur OpenAlexvenueno aff
Harsh Raman, Kerong Zhang, Mehmet Çakır, R. Appels, David F. Garvin, Lyza Maron, Leon V. Kochian, J. Sergio Moroni, Rosy Raman, Muhammad Imtiaz, F. Drake-Brockman, I. Waters, Peter J. Martin, Takayuki Sasaki, Yoko Yamamoto, Hideaki Matsumoto, Diane M. Hebb, Emmanuel Delhaize, Peter R. Ryan

Notice bibliographique

RevueGenome · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAluminum toxicity and tolerance in plants and animals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNew South Wales GovernmentCommonwealth Scientific and Industrial Research Organisation
Mots-clésBiologyGeneticsGeneQuantitative trait locusAegilops tauschiiAlleleGenetic linkageLocus (genetics)ExonGene mappingCommon wheatChromosomePloidy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The major aluminum (Al) tolerance gene in wheat ALMT1 confers. An Al-activated efflux of malate from root apices. We determined the genomic structure of the ALMT1 gene and found it consists of 6 exons interrupted by 5 introns. Sequencing a range of wheat genotypes identified 3 alleles for ALMT1, 1 of which was identical to the ALMT1 gene from an Aegilops tauschii accession. The ALMT1 gene was mapped to chromosome 4DL using 'Chinese Spring' deletion lines, and loss of ALMT1 coincided with the loss of both Al tolerance and Al-activated malate efflux. Aluminium tolerance in each of 5 different doubled-haploid populations was found to be conditioned by a single major gene. When ALMT1 was polymorphic between the parental lines, QTL and linkage analyses indicated that ALMT1 mapped to chromosome 4DL and cosegregated with Al tolerance. In 2 populations examined, Al tolerance also segregated with a greater capacity for Al-activated malate efflux. Aluminium tolerance was not associated with a particular coding allele for ALMT1, but was significantly correlated with the relative level of ALMT1 expression. These findings suggest that the Al tolerance in a diverse range of wheat genotypes is primarily conditioned by ALMT1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations158
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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