The Polymorphism of EME1 Gene is Associated with an Increased Risk of Lung Cancer: A Case-Control Study from Chinese Population
Notice bibliographique
Résumé
DNA double-strand breaks (DSBs) can lead to genomic instability and cancer susceptibility if unrepaired. EME1 is one of the key proteins that participate in the recognition and repair of DSBs in humans. We hypothesized that the exonic variants of EME1 are associated with lung cancer risk. In a two-stage case-control study of 1559 lung cancer patients and 1679 cancer-free controls, we genotyped two exonic variants of EME1(Glu69Asp: rs3760413T>G and Ile350Thr: rs12450550T>C) and analyzed their associations with risk of lung cancer. We found that the Asp variant genotypes conferred 1.35-folds risk of lung cancer compared to the Glu/Glu genotype (OR = 1.35, 95%CI = 1.18-1.56, P = 2.18 ƒ 10-5) in both stages. However, the SNP Ile350Thr was not confirmed to be associated with cancer risk in both stages. Moreover, by querying the gene expression database, we further found that the 69Asp variant genotypes confer a significantly lower mRNA expression of EME1 than the Glu/Glu genotype in 260 cases of lymphoblastoid cells (P=0.013). Our findings suggested that the SNP Glu69Asp of EME1 is associated with an increased risk of lung cancer, and may be a functional biomarker to predict lung cancer risk in Chinese. Validations in other ethnics are warranted.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».