A novel actin-related protein gene of<i>Colletotrichum gloeosporioides</i>f. sp.<i>malvae</i>shows altered expression corresponding with spore production
Notice bibliographique
Résumé
A novel actin-related protein (arp) was found in the plant pathogenic fungus, Colletotrichum gloeosporioides f. sp. malvae (Cgm), which causes anthracnose disease of round-leaved mallow (Malva pusilla). Sequence comparisons showed that this gene, arpA, belongs to the highly divergent 'other arps' category in the current arp classification system. ArpA is most similar to the arp11 gene of Mus musculus but has a unique structure with deletions at the C-terminus similar to that of the arp10 gene of Saccharomyces cerevisiae. A portion of another putative arp gene, arpB, was found immediately downstream of arpA. Expression of arpA was compared to the constitutively expressed Cgm actin gene, actA. In culture, the relative expression of arpA increased when growth conditions favored sporulation. During infection, arpA expression was greatest at the late necrotrophic phase, when sporulation occurred. Arps have been shown to be important in nuclear migration in fungal hyphae, and the expression pattern of arpA indicates that it may have a particular role during sporulation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».