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Enregistrement W2013290757 · doi:10.1016/j.jalz.2010.05.142

IC‐P‐127: Statistical Analysis of Automated Hippocampal Volumes in ADNI Dataset Reveals Center and Group Variability

2010· article· en· W2013290757 sur OpenAlexaff
Abderazzak Mouiha, Fernando Valdivia, Simon Duchesne

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAnalysis of varianceNuclear medicineCenter (category theory)Hippocampal formationCognitive impairmentMedicineStatistical analysisPsychologyStatisticsInternal medicineMathematicsDiseaseChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hippocampal (HC) atrophy is a key diagnostic marker for Alzheimer's disease (AD). While manual segmentation by trained raters is the reference standard procedure for assessing HC volumes, a number of computer-based techniques have been proposed to automate this task. It is known in manual studies that different anatomical definitions and protocols result in heterogeneous estimates of normal HC volumes, from 2 to 5.3 cm3 (Geuze et al., Mol Psychiatry 2005;10:147-59). Our goal was to assess this variability by Centres and diagnostic Groups (AD, mild cognitive impairment (MCI) and controls (CTRL)) for automatically generated HC volumes. We downloaded automatically generated left and right HC volume data from the ADNI dataset (last access: Nov. 2009) for three different Centers: UCSF (FreeSurfer); UCSD (Semi-automated diffeomorphism); and U of Az. (SPM). Statistical analysis was performed using SAS (Cary, NC, USA). The total number of subjects available in the study was 766, from which 531 subjects had data from all three Centers. Summary statistics are presented in Table 1. Two-way ANOVA for left HC volumes showed statistically significant Center (p < 0.0001) and Group effects (p < 0.0001), as well as a weak interaction (Figure 1) leading to a significant Center by Group effect (p = 0.0001). Similar testing on right HC volumes showed equally significant Center (p < 0.0001) and Group effects (p < 0.0001), with smaller interaction (Figure 2) yet significant Center by Group effect (p = 0.0045).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,042

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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