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Enregistrement W2013423277 · doi:10.1534/genetics.105.042002

Genomic Mutation in Lines of<i>Arabidopsis thaliana</i>Exposed to Ultraviolet-B Radiation

2005· article· en· W2013423277 sur OpenAlexaff
Joanna L MacKenzie, Fabienne E. Saadé, Quang Hien Le, Thomas E. Bureau, Daniel J. Schoen

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEvolution and Genetic Dynamics
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneticsArabidopsis thalianaMutationUltraviolet B radiationUltraviolet radiationArabidopsisGeneMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Studies that have attempted to estimate the rate of deleterious mutation have typically been conducted under low levels of ultraviolet-B (UV-B) radiation, a naturally occurring mutagen. We conducted experiments to test whether the inclusion of natural levels of UV-B radiation in mutation-accumulation (MA) experiments influences the rate and effects of mildly deleterious mutation in the plant Arabidopsis thaliana. Ten generations of MA proved insufficient to observe significant changes in means or among-line variances in experimental lines maintained either with or without supplemental UV-B radiation. Maximum-likelihood estimates of mutation rate for total flower number revealed a small but significant rate of mutation for MA lines propagated under supplemental UV-B exposure, but not for those in which supplemental UV-B was omitted. A fraction of the flower number mutations under UV-B (approximately 25-30%) are estimated to increase flower number. Results from the application of transposon display to plant materials obtained after MA, in both the presence and absence of supplemental UV-B, suggest that the average rate of transposition for the class I and II transposable elements (TEs) surveyed was no more than 10(-4). Overall, the estimates of mutation parameters are qualitatively similar to what has been observed in other MA experiments with this species in which supplemental UV-B levels have not been used. As well, it appears that naturally occurring levels of UV-B do not lead to detectable increases in levels of transposable element activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,235
Score d'incertitude au seuil0,533

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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