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Enregistrement W2013434800 · doi:10.1089/oli.2007.0116

DNase I–tRNA Interaction

2008· article· en· W2013434800 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueOligonucleotides · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-RivièresInnovation and Economic Development Trois Rivières
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésTransfer RNAPolynucleotideBiologyDNADeoxyribonuclease IRNADeoxyribonucleaseDivalentBiochemistryDuplex (building)Helix (gastropod)Hypersensitive siteConformational changeBinding constantBinding siteBiophysicsChemistryBase sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Deoxyribonuclease I (DNase I) binds right-handed DNA duplex via a minor groove and the backbone phosphate group with no contact to the major groove. It hydrolyses double-stranded DNA predominantly by a single-stranded nicking mechanism under physiological conditions, in the presence of divalent Mg and Ca cations. Even though DNase-RNA interaction was observed, less is known about the protein-RNA binding mode and the effect of such complexation on both protein and RNA conformations. The aim of this study was to examine the effects of DNase I-tRNA interaction on tRNA and protein conformations. The interaction of DNase I with tRNA is monitored under physiological conditions, in the absence of Mg2+, using constant DNA concentration of 12.5 mM (phosphate) and various protein contents (10 microM to 250 microM). FTIR, UV-visible, and CD spectroscopic methods were used to analyze the protein binding mode, the binding constant, and the effects of polynucleotide-enzyme interaction on both tRNA and protein conformations. Spectroscopic evidence showed major DNase-PO2 and minor groove interactions with overall binding constant of K = 2.1 (+/-0.7) x 10(4) M(-1). The DNase I-tRNA interaction alters protein secondary structure with major reduction of the alpha-helix, and increases the random coil, beta-anti and turn structures, while tRNA remains in the A-conformation. No digestion of tRNA by DNase I was observed in the protein-tRNA complexes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,132
Score d'incertitude au seuil0,490

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle