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Enregistrement W2013503399 · doi:10.1089/dna.2007.0680

The Transactivation Function of the Pea3 Subfamily Ets Transcription Factors Is Regulated by Sumoylation

2008· article· en· W2013503399 sur OpenAlexafffund
Bojana Bojović, John A. Hassell

Notice bibliographique

RevueDNA and Cell Biology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSUMO proteinTransactivationBiologyTranscription factorSubfamilyETS transcription factor familyGeneticsLysineCell biologyUbiquitinGeneAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pea3, an Ets transcriptional factor, comprises multiple regulatory domains that affect its DNA binding and transcriptional activation. The aim of this work is to uncover the mechanism of action of negative regulatory regions flanking the transactivation domain. Mutagenesis of amino acid residues in the C-terminal negative regulatory region for transactivation revealed critical residues, including a lysine residue, K96, required for its function. Corresponding mutations in the closely related Pea3 subfamily members, Erm and Er81, also dramatically increased the transactivation capacity of their activation domains. Interestingly, all three proteins are sumoylated at this conserved lysine residue. Pea3 contains four other lysines, K222, K256, K318, and K437, embedded in a perfect SUMO consensus motif. The contribution of these lysine residues to the regulation of Pea3 activity and their sumoylation pattern was explored using a GAL4-PEA3 chimera devoid of the ETS DNA-binding domain and by analyzing the native protein. All four candidate SUMO sites included in the GAL4-PEA3 chimera were modified by sumoylation, and their simultaneous mutation dramatically increased the transactivation potential of Pea3. Similar analysis of full-length Pea3 confirmed K96, K222, and K256 as major SUMO modification sites. Collectively, these observations suggest that the activity of Pea3 and its paralogs, Erm and Er81, is negatively regulated by sumoylation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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