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Enregistrement W2013513647 · doi:10.1038/cddis.2010.4

Excessive HDAC activation is critical for neurodegeneration in the rd1 mouse

2010· article· en· W2013513647 sur OpenAlexaff
Javier Sancho-Pellúz, Marcel V. Alavi, Ayse Sahaboglu, Stefan Kustermann, Pietro Farinelli, Seifollah Azadi, T. van Veen, Francisco J. Romero, François Paquet‐Durand, Per Ekström

Notice bibliographique

RevueCell Death and Disease · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésAcetylationHistone deacetylaseHistoneNeurodegenerationBiologyRetinitis pigmentosaHistone AcetyltransferasesRetinal degenerationProgrammed cell deathCell biologyHDAC1RetinalGeneticsBiochemistryMedicineApoptosisGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inherited retinal degenerations, collectively termed retinitis pigmentosa (RP), constitute one of the leading causes of blindness in the developed world. RP is at present untreatable and the underlying neurodegenerative mechanisms are unknown, even though the genetic causes are often established. Acetylation and deacetylation of histones, carried out by histone acetyltransferases (HATs) and histone deacetylases (HDACs), respectively, affects cellular division, differentiation, death and survival. We found acetylation of histones and probably other proteins to be dramatically reduced in degenerating photoreceptors in the rd1 human homologous mouse model for RP. Using a custom developed in situ HDAC activity assay, we show that overactivation of HDAC classes I/II temporally precedes photoreceptor degeneration. Moreover, pharmacological inhibition of HDACs I/II activity in rd1 organotypic retinal explants decreased activity of poly-ADP-ribose-polymerase and strongly reduced photoreceptor cell death. These findings highlight the importance of protein acetylation for photoreceptor cell death and survival and propose certain HDAC classes as novel targets for the pharmacological intervention in RP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations126
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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