MétaCan
Menu
Retour à la cohorte

Comparative analysis and application of fluorescent protein-tagged connexins

2001· article· en· W2013546443 sur OpenAlexafffund
Dale W. Laird, Karen Jordan, Tamsin Thomas, Hong Qin, P Fistouris, Qing Shao

Notice bibliographique

RevueMicroscopy Research and Technique · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueConnexins and lens biology
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesMedical Research Council Canada
Mots-clésLucifer yellowGreen fluorescent proteinConnexinFusion proteinYellow fluorescent proteinGap junctionFluorescenceFörster resonance energy transferChimera (genetics)Fluorescent proteinCell biologyProtein tagDegronChemistryBiologyBiophysicsBiochemistryRecombinant DNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In order to examine connexin transport, assembly, and turnover in living cells, we tagged green fluorescent protein or its color variants to several members of the connexin family of proteins. When green fluorescent protein was tagged to the carboxyl terminal end of connexin43 (Cx43-GFP), the resulting fusion protein was transported and assembled into functional gap junctions. However, when GFP was tagged to the amino terminal end of Cx43 (GFP-Cx43), this chimera was biosynthesized, transported to the plasma membrane, but failed to form gap junction channels that could transfer Lucifer yellow. Single cells that expressed Cx43-GFP were capable of transporting this fusion protein to the cell surface in the absence of cell-cell contact. Imaging of Cx43-yellow (Y)FP (Cx43-YFP) was quite efficient; however, the low quantum yield Cx43-BFP and the requirement for ultraviolet excitation made this chimera less suitable for time-lapse imaging. Cx43-cyan C(FP) (Cx43-CFP) was more suitable for imaging than Cx43-blue (B)FP and could be effectively separated from Cx43-YFP. The versatility of tagging GFP to the carboxyl terminal end of other members of the connexin family was established when Cx32-GFP and Cx26-YFP were found to assemble into gap junctions capable of transferring Lucifer yellow. Finally, we are examining the effectiveness of using a new red fluorescent protein (DsRed) fused to connexins in combination with Cx-GFP to simultaneously examine the kinetics, transport and turnover of two connexins. Together, our studies suggest that tagging fluorescent proteins to the carboxyl terminal end of connexins is an effective and valuable approach for studying the life cycle and dynamics of connexins in living cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,326

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,349 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMicroscopy Research and TechniqueMême sujetConnexins and lens biologyTravaux en français237 207