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Enregistrement W2013604487 · doi:10.1097/pas.0b013e3182253800

Does Neoadjuvant Therapy Alter KRAS and/or MSI Results in Rectal Adenocarcinoma Testing?

2011· article· en· W2013604487 sur OpenAlexaff
Sarah L. Ondrejka, David F. Schaeffer, Maureen Jakubowski, David Owen, Mary P. Bronner

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Surgical Pathology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Treatments and Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésKRASMicrosatellite instabilityColorectal cancerAdenocarcinomaMedicineNeoadjuvant therapyOncologyInternal medicineCancerChemoradiotherapyMicrosatelliteBiologyGeneBreast cancerGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To our knowledge, the genotoxic effects of neoadjuvant chemoradiation therapy on molecular diagnostic testing results are unknown. However, if neoadjuvant treatments were to alter molecular test results, clinical decision-making could be misled. This raises questions about the appropriateness of using posttreatment tumor for testing. To address this, rectal adenocarcinomas both before and after neoadjuvant treatment were evaluated for alterations in KRAS and microsatellite instability (MSI) testing. Neoadjuvant chemoradiation therapy is common in this tumor type, and alterations in these 2 tests would significantly impact management. A total of 17 rectal adenocarcinoma patients with available pretreatment and posttreatment tumor were studied. MSI testing used the revised National Cancer Institute panel of 5 mononucleotide microsatellite repeats, comparing cancers with matched normal control tissues. KRAS codon 12-point and 13-point mutations were examined by polymerase chain reaction amplification and bidirectional sequencing. MSI and KRAS results were unchanged comparing rectal cancer tissue before and after chemoradiotherapy in all 17 patients (P=1.000; 95% CI: 0.3969-2.520). All 17 tumors (100%) were microsatellite stable. KRAS testing identified 12 (72%) wild-type tumors and 5 (28%) codon 12 or 13 mutant tumors with identical KRAS point mutations before and after treatment. The identified MSI and KRAS mutational prevalences parallel those reported in the rectal cancer literature. Neoadjuvant therapy did not alter KRAS codon 12 or 13 or MSI results in rectal adenocarcinoma, providing evidence that either pretreatment biopsy or posttreatment resection tissues are appropriate for testing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,035
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,040

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,035
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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