PEST family phosphatases in immunity, autoimmunity, and autoinflammatory disorders
Notice bibliographique
Résumé
The proline-, glutamic acid-, serine- and threonine-rich (PEST) family of protein tyrosine phosphatases (PTPs) includes proline-enriched phosphatase (PEP)/lymphoid tyrosine phosphatase (LYP), PTP-PEST, and PTP-hematopoietic stem cell fraction (HSCF). PEP/LYP is a potent inhibitor of T-cell activation, principally by suppressing the activity of Src family protein tyrosine kinases (PTKs). This function seems to be dependent, at least in part, on the ability of PEP to bind C-terminal Src kinase (Csk), a PTK also involved in inactivating Src kinases. Interestingly, a polymorphism of LYP in humans (R620W) is a significant risk factor for autoimmune diseases including type 1 diabetes, rheumatoid arthritis, and lupus. The R620W mutation may be a 'gain-of-function' mutation. In non-hematopoietic cells, PTP-PEST is a critical regulator of adhesion and migration. This effect correlates with the aptitude of PTP-PEST to dephosphorylate cytoskeletal proteins such as Cas, focal adhesion associated-kinase (FAK), Pyk2, and PSTPIP. While not established, a similar function may also exist in immune cells. Additionally, overexpression studies provided an indication that PTP-PEST may be a negative regulator of lymphocyte activation. Interestingly, mutations in a PTP-PEST- and PTP-HSCF-interacting protein, PSTPIP1, were identified in humans with pyogenic sterile arthritis, pyoderma gangrenosum, and acne (PAPA) syndrome and familial recurrent arthritis, two autoinflammatory diseases. These mutations abrogate the ability of PSTPIP1 to bind PTP-PEST and PTP-HSCF, suggesting that these two PTPs may be negative regulators of inflammation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».