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Enregistrement W2013612087 · doi:10.1021/bp9901522

Combining Cell Culture Analogue Reactor Designs and PBPK Models to Probe Mechanisms of Naphthalene Toxicity

2000· article· en· W2013612087 sur OpenAlexfundno aff
Ahmed Ghanem, Michael L. Shuler

Notice bibliographique

RevueBiotechnology Progress · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCarcinogens and Genotoxicity Assessment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésNaphthalenePhysiologically based pharmacokinetic modellingToxicityBiochemical engineeringChemistryEnvironmental chemistryPharmacologyPharmacokineticsOrganic chemistryBiologyEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An alternative method of evaluating the toxicology of a chemical is to use cultured mammalian cells in a novel cell culture analogue reactor (CCA) together with a corresponding physiologically based pharmacokinetic model (PBPK). The PBPK is a mathematical model that divides the body into compartments representing organs, integrating the kinetic, thermodynamic, and anatomical parameters of the animal. The bioreactor is a physical replica of the PBPK; where the PBPK specifies an organ or tissue compartment, the bioreactor contains compartments with a corresponding cell type. The device is a continuous, dynamic system composed of multiple cell types that interact through a common circulating cell culture medium. The bioreactor and the model are coupled to evaluate the plausibility of the molecular mechanism that is input into the model. This concept is tested with naphthalene as a model of PAH (polycyclic aromatic hydrocarbons) toxicants. Two physically different CCA reactors were tested with naphthalene, and different results were observed. In the prototype system using cells attached to glass dilution bottles, naphthalene dosing resulted in generation of a circulating metabolite from the "liver" compartment (based on H4IIE cells from a rat hepatoma) that caused cell death in the "lung" compartment (L2 cells from a rat lung), as well as depletion of glutathione in the L2 cells. An improved CCA using packed bed reactors of microcarrier cultured cells did not show differences between naphthalene-dosed and nondosed controls. To explain the different responses of the two CCA designs, PBPKs of the two reactors were tested with variations in physical and kinetic parameters, and toxic mechanism. When the toxic metabolite of naphthalene was naphthoquinone rather than naphthalene epoxide as initially assumed, the PBPK results were consistent with the results of the two CCA designs. This result indicates that the mechanism of naphthalene toxicity in the CCAs may be mediated through naphthoquinone formation. The CCA-PBPK concept is demonstrated to be applicable to the study of toxic mechanisms. In particular, use of this approach suggests that in vitro naphthalene toxicity is mediated through the naphthoquinone metabolite.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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