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Enregistrement W2013617932 · doi:10.1117/12.2005975

A photoacoustic technique to measure the properties of single cells

2013· article· en· W2013617932 sur OpenAlexafffund
Eric M. Strohm, Elizabeth Berndl, Michael C. Kolios

Notice bibliographique

RevueProceedings of SPIE, the International Society for Optical Engineering/Proceedings of SPIE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiquePhotoacoustic and Ultrasonic Imaging
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesResearch and Innovation FoundationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsCancer Research Institute
Mots-clésMeasure (data warehouse)Photoacoustic imaging in biomedicineComputer scienceMaterials scienceOptoelectronicsOpticsPhysicsData mining

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We demonstrate a new technique to non-invasively determine the diameter and sound speed of single cells using a combined ultrasonic and photoacoustic technique. Two cell lines, B16-F1 melanoma cells and MCF7 breast cancer cells were examined using this technique. Using a 200 MHz transducer, the ultrasound backscatter from a single cell in suspension was recorded. Immediately following, the cell was irradiated with a 532 nm laser and the resulting photoacoustic wave recorded by the same transducer. The melanoma cells contain optically absorbing melanin particles, which facilitated photoacoustic wave generation. MCF7 cells have negligible optical absorption at 532 nm; the cells were permeabilized and stained with trypan blue prior to measurements. The measured ultrasound and photoacoustic power spectra were compared to theoretical equations with the cell diameter and sound speed as variables (Anderson scattering model for ultrasound, and a thermoelastic expansion model for photoacoustics). The diameter and sound speed were extracted from the models where the spectral shape matched the measured signals. However the photoacoustic spectrum for the melanoma cell did not match theory, which is likely because melanin particles are located around the cytoplasm, and not within the nucleus. Therefore a photoacoustic finite element model of a cell was developed where the central region was not used to generate a photoacoustic wave. The resulting power spectrum was in better agreement with the measured signal than the thermoelastic expansion model. The MCF7 cell diameter obtained using the spectral matching method was 17.5 μm, similar to the optical measurement of 16 μm, while the melanoma cell diameter obtained was 22 μm, similar to the optical measurement of 21 μm. The sound speed measured from the MCF7 and melanoma cell was 1573 and 1560 m/s, respectively, which is within acceptable values that have been published in literature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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