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Enregistrement W2013640498 · doi:10.4161/epi.19836

Epigenetic regulation of glucocorticoid receptor expression in aorta from mice with hyperhomocysteinemia

2012· article· en· W2013640498 sur OpenAlexafffund
Dian Caturini Sulistyoningrum, Ranji Singh, Angela M. Devlin

Notice bibliographique

RevueEpigenetics · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensChild and Family Research InstituteUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesChild and Family Research Institute
Mots-clésBiologyDNA methylationEpigeneticsChromatin immunoprecipitationMethylationGene expressionGlucocorticoid receptorMolecular biologyRegulation of gene expressionEndocrinologyHyperhomocysteinemiaInternal medicineHomocysteineGenePromoterGlucocorticoidGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hyperhomocysteinemia (HHcy) is a risk factor for vascular disease but its underlying molecular pathology is not understood. Homocysteine is metabolically linked to the epigenetic process of DNA methylation. Tissue-specific changes in DNA methylation have been observed in HHcy but little is known about vascular tissue. The objective of this study was to determine if changes in the epigenetic regulation of glucocorticoid receptor (GR) expression (encoded by Nr3c1) in aorta are associated with HHcy. C57BL/6 mice heterozygous for disruption of the cystathionine-β-synthase gene (Cbs+/-) and controls (Cbs+/+) were fed a control or high methionine/low folate (HH) diet to induce HHcy. Cbs+/- and Cbs+/+ fed the HH diet had higher plasma total homocysteine levels (19.9 ± 3.2 and 7.0 ± 0.9 μM, respectively) than Cbs+/+ mice fed the control diet (2.7 ± 0.2 μM), and this was accompanied by lower Nr3c1 mRNA and lower GR protein in aorta. The Nr3c1 gene contains multiple first exons producing heterogeneous RNA transcripts expressed in a tissue-specific manner. We identified expression of two transcripts in aorta. Bisulfite pyrosequencing found increased methylation of the promoter regions for these transcripts at sites corresponding to Sp1 and Nrf1 binding sites. Chromatin immunoprecipitation found lower binding of Nrf1 to the Nr3c1 promoter but higher expression of Nrf1 protein in aorta from mice with HHcy. These findings show methylation and silencing of vascular Nr3c1 expression and suggest a role for epigenetic regulation of gene expression in HHcy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,142
Score d'incertitude au seuil0,471

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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