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Enregistrement W2013697075 · doi:10.1021/bi061692s

Specific Mutations in Transmembrane Helix 8 of Human Concentrative Na<sup>+</sup>/Nucleoside Cotransporter hCNT1 Affect Permeant Selectivity and Cation Coupling

2007· article· en· W2013697075 sur OpenAlexaff
Melissa D. Slugoski, Shaun Loewen, Amy M.L. Ng, Kyla M. Smith, Sylvia Y.M. Yao, Edward Karpinski, Carol E. Cass, Stephen A. Baldwin, James D. Young

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdenosine and Purinergic Signaling
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNucleosideCytidineUridineCotransporterTransmembrane domainBiochemistryMutagenesisChemistryBiophysicsBiologyStereochemistryMutationAmino acidRNAGeneEnzymeSodium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Na+/nucleoside cotransporters hCNT1 (650 residues) and hCNT2 (658 residues) are 72% identical in amino acid sequence and contain 13 putative transmembrane helices (TMs). Both transport uridine and adenosine but are otherwise selective for pyrimidine (system cit) and purine (system cif) nucleosides, respectively. Previously, we used site-directed mutagenesis and functional expression in Xenopus oocytes to identify two pairs of adjacent residues in TMs 7 and 8 of hCNT1 (Ser319-Gln320 and Ser353-Leu354) that, when converted to the corresponding residues in hCNT2 (Gly-Met and Thr-Val, respectively), changed the permeant selectivity of the transporter from cit to cif. We now report an investigation of the effects of corresponding mutations in TM 8 alone and demonstrate unique S353T- and L354V-induced changes in nucleoside specificity and cation coupling, respectively. hCNT1 mutation S353T produced a profound decrease in cytidine transport efficiency (Vmax/Km ratio) and, in combination with L354V (S353T/L354V), resulted in a novel uridine-preferring transport phenotype. In addition, the L354V mutation markedly increased the apparent affinity of hCNT1 for Na+ and Li+. Both hCNT1 TM 8 residues exhibited uridine-protectable inhibition by p-chloromercuribenzene sulfonate when converted to Cys, suggesting that they occupy positions within or closely adjacent to a common cation/nucleoside translocation pore.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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