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Enregistrement W2013736307 · doi:10.1074/jbc.m111.244616

Flanking Residues Help Determine Whether a Hydrophobic Segment Adopts a Monotopic or Bitopic Topology in the Endoplasmic Reticulum Membrane

2011· article· en· W2013736307 sur OpenAlex
Morten H. H. Nørholm, Yulia V. Shulga, Satoko Aoki, Richard M. Epand, Gunnar von Heijne

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCaveolin-1 and cellular processes
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaH. Lundbeck A/SLundbeckfondenVetenskapsrådetStiftelsen för Strategisk ForskningSwedish Cancer Foundation
Mots-clésDiacylglycerol kinaseMembrane topologyEndoplasmic reticulumMembrane proteinTopology (electrical circuits)MembraneGene isoformChemistryBiochemistryBiophysicsBiologyEnzymeProtein kinase CGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proteins interacting with membranes via a single hydrophobic segment can be classified as either monotopic or bitopic. Here, we probe the topology of a membrane-attached enzyme, the ε isoform of human diacylglycerol kinase (DGKε), when inserted into rough microsomes and compare it with the monotopic membrane protein mouse caveolin-1. In contrast to previous findings, the N-terminal hydrophobic stretch in DGKε attains a bitopic rather than a monotopic topology in our experimental system. In addition, we find that charged flanking residues as well as proline residues embedded in the hydrophobic segment are important determinants of monotopic versus bitopic topology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,413

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle