Tryptophan Mutants of Cardiac Troponin C: 3D Structure, Troponin I Affinity, and<i>in Situ</i>Activity<sup>,</sup>
Notice bibliographique
Résumé
In situ fluorescence/NMR spectroscopic approaches have been used to elucidate the structure, mobility, and domain orientations of troponin C in striated muscle. This led us to consider complementary approaches such as solid-state NMR spectroscopy. The biophysical properties of tryptophan and Trp-analogues, such as fluorotryptophan or hydroxytryptophan, are often exploited to probe protein structure and dynamics using solid-state NMR or fluorescence spectroscopy. We have characterized Phe-to-Trp mutants in the 'structural' C-domain of cardiac troponin C, designed to immobilize the indole ring in the hydrophobic core of the domain. The mutations and their fluorinated analogues (F104W, F104(5fW), F153W, and F153(5fW)) were shown not to perturb the structural properties of the protein. In this paper, we characterize the mutations F77W and F77W-V82A in the 'regulatory' N-domain of cardiac troponin C. We used NMR to determine the structure and dynamics of the mutant F77W-V82A-cNTnC, which shows a unique orientation of the indole ring. We observed a decrease in calcium binding affinity and a weaker affinity for the switch region of TnI for both mutants. We present force recovery measurements for all of the N- and C-domain mutants reconstituted into skeletal muscle fibers. The F77W mutation leads to a reduction of the in situ force recovery, whereas the C-domain mutants have the same activity as the wild type. These results suggest that the perturbations of the N-domain caused by the Trp mutation disturb the interaction between TnC and TnI, which in turn diminishes the activity in fibers, providing a clear example of the correlation between in vitro protein structures, their interactions, and the resulting in situ physiological activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».