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Enregistrement W2013908828 · doi:10.1074/jbc.m311218200

Molecular Mechanisms of Cl- Transport by the Renal Na+-K+-Cl- Cotransporter

2004· article· en· W2013908828 sur OpenAlexaff
Édith Gagnon, Marc J. Bergeron, Geneviève M. Brunet, Nikolas D. Daigle, Charles F. Simard, Paul Isenring

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCotransporterChemistryAlternative splicingExonTransporterGene isoformTransmembrane domainAffinitiesBiophysicsIntracellularBiochemistryCrystallographyStereochemistryBiologyGeneSodium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The 2nd transmembrane domain (tm) of the secretory Na(+)-K(+)-Cl(-) cotransporter (NKCC1) and of the kidney-specific isoform (NKCC2) has been shown to play an important role in cation transport. For NKCC2, by way of illustration, alternative splicing of exon 4, a 96-bp sequence from which tm2 is derived, leads to the formation of the NKCC2A and F variants that both exhibit unique affinities for cations. Of interest, the NKCC2 variants also exhibit substantial differences in Cl- affinity as well as in the residue composition of the first intracellular connecting segment (cs1a), which immediately follows tm2 and which too is derived from exon 4. In this study, we have prepared chimeras of the shark NKCC2A and F (saA and saF) to determine whether cs1a could play a role in Cl- transport; here, tm2 or cs1a in saF was replaced by the corresponding domain from saA (generating saA/F or saF/A, respectively). Functional analyses of these chimeras have shown that cs1a-specific residues account for most of the A-F difference in Cl- affinity. For example, Km(Cl-)s were approximately 8 mm for saF/A and saA, and approximately 70 mm for saA/F and saF. Intriguingly, variant residues in cs1a also affected cation transport; here, Km(Na+)s for the chimeras and for saA were all approximately 20 mM, and Km(Rb+) all approximately 2 mM. Regarding tm2, our studies have confirmed its importance in cation transport and have also identified novel properties for this domain. Taken together, our results demonstrate for the first time that an intracellular loop in NKCC contributes to the transport process perhaps by forming a flexible structure that positions itself between membrane spanning domains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,445

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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