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Enregistrement W2013943906 · doi:10.1021/jm401304h

Understanding the Recognition of Lewis X by Anti-Le<sup>x</sup> Monoclonal Antibodies

2013· article· en· W2013943906 sur OpenAlexaff
Christopher J. Moore, France‐Isabelle Auzanneau

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMast cells and histamine
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryMonoclonal antibodyAntibodyStereochemistryImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The recognition of the Le(x) antigen by the anti-Le(x) monoclonal antibody (mAb) SH1 was studied by ELISA using a panel of 4″-modified Le(x) analogues. We confirmed that these analogues maintained the stacked conformation adopted by natural Le(x) antigen using 1D ROESY experiments and measuring intramolecular distances. Our binding studies show that the 4-OH″ of galactose behaves as an H-bond donor to an electronegative amino acid side chain in the SH1 binding site. While removal of this H-bond leads to reduced inhibition, disturbing the hydrophobic α face of the β-galactosyl residue leads to complete loss of binding to SH1. We compared our results to the crystal structure of the Fab fragment of anti-Le(x) mAb 291-2G3-A complexed with Le(x) (PDB entry 1UZ8 ). While no H-bond involving the 4-OH″ was described, hydrophobic interactions between a tryptophan residue and the β-galactoside α face are observed. We conclude that the hydrophobic α face that is uniquely displayed by β-galactosyl residues is essential to the recognition of the Le(x) antigen by anti-Le(x) antibodies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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