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Enregistrement W2014114319 · doi:10.1186/1471-2229-13-215

A novel dominant glossy mutation causes suppression of wax biosynthesis pathway and deficiency of cuticular wax in Brassica napus

2013· article· en· W2014114319 sur OpenAlexafffund
Yuanyuan Pu, Jie Gao, Yanli Guo, Tingting Liu, Lixia Zhu, Ping Xu, Bin Yi, Jing Wen, Jinxing Tu, Chaozhi Ma, Tingdong Fu, Jitao Zou, Jinxiong Shen

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Surface Properties and Treatments
Établissements canadiensNational Research Council CanadaSaskatchewan Research Council (Canada)
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaSouth China Agricultural UniversityNational High-tech Research and Development ProgramChina Scholarship CouncilChina Agricultural University
Mots-clésBiologyWaxMutantGeneBrassicaGeneticsBulked segregant analysisBotanyGene mappingBiochemistryChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The aerial parts of land plants are covered with cuticular waxes that limit non-stomatal water loss and gaseous exchange, and protect plants from ultraviolet radiation and pathogen attack. This is the first report on the characterization and genetic mapping of a novel dominant glossy mutant (BnaA.GL) in Brassica napus. RESULTS: Transmission electron microscopy revealed that the cuticle ultrastructure of GL mutant leaf and stem were altered dramatically compared with that of wide type (WT). Scanning electron microscopy corroborated the reduction of wax on the leaf and stem surface. A cuticular wax analysis of the GL mutant leaves further confirmed the drastic decrease in the total wax content, and a wax compositional analysis revealed an increase in aldehydes but a severe decrease in alkanes, ketones and secondary alcohols. These results suggested a likely blockage of the decarbonylation step in the wax biosynthesis pathway. Genetic mapping narrowed the location of the BnaA.GL gene to the end of A9 chromosome. A single-nucleotide polymorphism (SNP) chip assay in combination with bulk segregant analysis (BSA) also located SNPs in the same region. Two SNPs, two single sequence repeat (SSR) markers and one IP marker were located on the flanking region of the BnaA.GL gene at a distance of 0.6 cM. A gene homologous to ECERIFERUM1 (CER1) was located in the mapped region. A cDNA microarray chip assay revealed coordinated down regulation of genes encoding enzymes of the cuticular wax biosynthetic pathway in the glossy mutant, with BnCER1 being one of the most severely suppressed genes. CONCLUSIONS: Our results indicated that surface wax biosynthesis is broadly affected in the glossy mutant due to the suppression of the BnCER1 and other wax-related genes. These findings offer novel clues for elucidating the molecular basis of the glossy phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,333
Score d'incertitude au seuil0,627

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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