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Enregistrement W2014121269 · doi:10.1074/jbc.m115.655043

A Point Mutation in the Ubiquitin Ligase RNF170 That Causes Autosomal Dominant Sensory Ataxia Destabilizes the Protein and Impairs Inositol 1,4,5-Trisphosphate Receptor-mediated Ca2+ Signaling

2015· article· en· W2014121269 sur OpenAlexaff
Forrest A. Wright, Justine P. Lu, Danielle A. Sliter, Nicolas Dupré, Guy A. Rouleau, Richard J.H. Wojcikiewicz

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Ataxia Foundation
Mots-clésUbiquitin ligaseUbiquitinEndoplasmic reticulumReceptorBiologyCell biologyNeurodegenerationSignal transductionPoint mutationInositol trisphosphate receptorMutantInositolBiochemistryInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RNF170 is an endoplasmic reticulum membrane ubiquitin ligase that contributes to the ubiquitination of activated inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) receptors, and also, when point mutated (arginine to cysteine at position 199), causes autosomal dominant sensory ataxia (ADSA), a disease characterized by neurodegeneration in the posterior columns of the spinal cord. Here we demonstrate that this point mutation inhibits RNF170 expression and signaling via IP3 receptors. Inhibited expression of mutant RNF170 was seen in cells expressing exogenous RNF170 constructs and in ADSA lymphoblasts, and appears to result from enhanced RNF170 autoubiquitination and proteasomal degradation. The basis for these effects was probed via additional point mutations, revealing that ionic interactions between charged residues in the transmembrane domains of RNF170 are required for protein stability. In ADSA lymphoblasts, platelet-activating factor-induced Ca2+ mobilization was significantly impaired, whereas neither Ca2+ store content, IP3 receptor levels, nor IP3 production were altered, indicative of a functional defect at the IP3 receptor locus, which may be the cause of neurodegeneration. CRISPR/Cas9-mediated genetic deletion of RNF170 showed that RNF170 mediates the addition of all of the ubiquitin conjugates known to become attached to activated IP3 receptors (monoubiquitin and Lys48- and Lys63-linked ubiquitin chains), and that wild-type and mutant RNF170 have apparently identical ubiquitin ligase activities toward IP3 receptors. Thus, the Ca2+ mobilization defect seen in ADSA lymphoblasts is apparently not due to aberrant IP3 receptor ubiquitination. Rather, the defect likely reflects abnormal ubiquitination of other substrates, or adaptation to the chronic reduction in RNF170 levels. Background: RNF170 is an endoplasmic reticulum membrane ubiquitin ligase that when mutated at arginine 199 causes a neurodegenerative disease. Results: The mutation disrupts salt bridges between transmembrane domains, destabilizes the protein, and inhibits Ca2+ signaling via IP3 receptors. Conclusion: These manifestations of the mutation are likely causative to neurodegeneration. Significance: Understanding the mechanism of action of mutant ubiquitin ligases will lead to better therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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