Genetic and physical characterization of chromosome 4DL in wheat
Notice bibliographique
Résumé
The long arm of chromosome 4D in wheat (Triticum aestivum L.) has been shown in previous studies to harbor genes of agronomic importance. A major dominant gene conferring Aluminum (Al) tolerance (Alt2 in 'Chinese Spring' and AltBH in 'BH 1146'), and the Knal locus controlling the K+/Na+ discrimination in saline environments have been mapped to this chromosome arm. However, accurate information on the genetic and physical location of markers related to any of these genes is not available and would be useful for map-based cloning and marker-assisted plant breeding. In the present study, using a population of 91 recombinant inbred lines segregating for Al tolerance, we provide a more extensive genetic linkage map of the chromosome arm 4DL based on RFLP, SSR, and AFLP markers, delimiting the AltBH gene to a 5.9-cM interval between markers Xgdm125 and Xpsr914. In addition, utilizing a set of wheat deletion lines for chromosome arm 4DL, the AltBH gene was physically mapped to the distal region of the chromosome, between deletion breakpoints 0.70 and 0.86, where the kilobase/centimorgan ratio is assumed to be low, making the map-based cloning of the gene a more realistic goal. The polymorphism rates in chromosome arm 4DL for the different types of markers used were extremely low, as confirmed by the physical mapping of AFLPs. Finally, analysis of 1 Mb of contiguous sequence of Arabidopsis chromosome 5 flanking the gene homologous to the BCD1230 clone (a cosegregating marker in our population coding for a ribulose-5-phosphate-3-epimerase gene), revealed a previously identified region of stress-related and disease-resistance genes. This could explain the collinearity observed in comparative mapping studies among different species and the low level of polymorphism detected in the chromosome arm 4DL in hexaploid wheat.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».