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Enregistrement W2014278139 · doi:10.1080/10611860600763079

Neuronal affinity of a C7C loop peptide identified through phage display

2006· article· en· W2014278139 sur OpenAlexfundno aff
Thais Federici, James K. Liu, Qingshan Teng, Mary E. Garrity‐Moses, Jun Yang, Nicholas M. Boulis

Notice bibliographique

RevueJournal of drug targeting · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of TorontoNational Science Council
Mots-clésBiopanningPhage displayPeptidePeptide libraryMolecular biologyBiologyImmunofluorescenceChemistryCell biologyPeptide sequenceAntibodyBiochemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phage display is a promising tool for the screening of peptides with high affinity for specific cells. Here we describe a novel peptide with neuronal affinity isolated from a C7C library. We designed a two-tiered biopanning strategy initially selecting for ganglioside binding and subsequently selecting for binding to PC12 cells. At the completion of biopanning, 54.8% of phage clones bore the identical peptide (Tet.C7C.1). Immunofluorescence confirmed selective binding of this clone to differentiated PC12 cells. Tet.C7C.1 was synthesized and fluorescein conjugated. The synthetic peptide binds neuronal cell lines (SH-SY5Y, NSC-34 and PC12 cells) and tissue (DRG and spinal cord). The C7C structure creates a loop that minimizes the impact of peptide insertion on the confirmation of the recipient protein. Small loop peptides have the ideal characteristics for modification of viral vector capsids without undermining genome packaging. The neuronal binding properties of this peptide may be applied in the development of neurotropic viral vectors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,518

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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