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Enregistrement W2014313053 · doi:10.1111/2049-632x.12104

Plasmid-mediated transformation tropism of chlamydial biovars

2013· article· en· W2014313053 sur OpenAlexaff
Lihua Song, John H. Carlson, Bing Zhou, Kimmo Virtaneva, William M. Whitmire, Gail L. Sturdevant, Stephen F. Porcella, Grant McClarty, Harlan D. Caldwell

Notice bibliographique

RevuePathogens and Disease · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of Health
Mots-clésPlasmidBiologyChlamydia trachomatisVirulenceTransformation (genetics)TropismShuttle vectorMicrobiologyVirologySerotypeTissue tropismGeneVector (molecular biology)GeneticsVirusRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chlamydia trachomatis and C. muridarum are human and mouse pathogens, respectively, which show high conservation of gene order and content. Both species contain a common 7.5-kb plasmid that is an important virulence factor. Recently described transformation systems have been used to characterize C. trachomatis L2 plasmid gene functions; however, similar studies have not been reported for C. trachomatis ocular tropic serovar A or the mouse strain, C. muridarum. Here, we have conducted genetic experiments with C. trachomatis serovar A and C. muridarum and report the following: (1) successful transformation of C. muridarum and C. trachomatis serovar A is restricted to a shuttle vector with a C. muridarum or C. trachomatis serovar A plasmid backbone, respectively; (2) transformation of plasmid-deficient C. muridarum with the C. muridarum-based shuttle vector complement glycogen accumulation and inclusion morphology; and (3) C. muridarum plasmid-encoded Pgp4 is a regulator of chromosomal (glgA) and plasmid (pgp3) virulence genes. In summary, our findings show a previously unrecognized and unexpected role for the chlamydial plasmid in its transformation tropism and confirm the plasmids regulatory role of virulence genes in C. muridarum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,785
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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