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Enregistrement W2014445119 · doi:10.1139/w04-031

A survey of the composition and diversity of bacterial populations in bleached kraft pulp-mill wastewater secondary treatment systems

2004· article· en· W2014445119 sur OpenAlexafffundvenue
Kimberley Gilbride, Roberta R. Fulthorpe

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueWastewater Treatment and Nitrogen Removal
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of TorontoMinistry of Environment
Mots-clésBiology16S ribosomal RNABacteroidetesFirmicutesPaper millMicrobial population biologyProteobacteriaRestriction fragment length polymorphismMicrobiologyBacteriaBotanyGeneGenotypeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacterial community compositions from 10 pulp- and paper-mill treatment systems were compared using both traditional and molecular techniques. 16S-RFLP (Random Fragment Length Polymorphisms) analysis was used to examine the genotypic profiles of the whole bacterial community of each treatment system. Although all the communities shared approximately 60% of their DNA band pattern, as determined by computer-assisted cluster analysis, each community displayed a unique profile that was stable over time under normal operating parameters. Reverse Sample Genome Probing (RSGP) and 16S-RFLP were used to compare the culturable bacterial communities of several geographically separated pulp-mill biotreatment system communities. There was little overlap in the composition of the culturable community between mills at the genus level. Furthermore, RSGP variation was almost as high within a mill as between mills. Partial sequences of the 16S rRNA genes from culturable isolates identified Bacillus spp., Pseudomonas spp., and Xanthobacter as some of the dominant species. Finally, several 16S rRNA genes from two whole community 16S RNA gene libraries were partially sequenced and identified as similar to unknown alpha-, beta-, and gamma-Proteobacteria, Ralstonia, Alcaligenes, Nitrospira, Firmicutes, and clones representing the new Holophaga/Acidobacterium phylum. These findings suggest that although these pulp- and paper-mill biotreatment communities perform similar functions, they are populated by unique mixtures of species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2004
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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