Towards gene therapy against HIV-1: new therapeutic target in gag RNA accessible to ribozymes and RNA interference molecules
Notice bibliographique
Résumé
We screened HIV-1 RNA to identify conserved target sites for new HDV-Rzs [ 2 ]. We designed new SOFA-HDV-Rzs against the Gag RNA and developed a rapid test to evaluate the inhibition of HIV-1 production. We designed small interfering (si) RNAs targeting the same region and tested their activity on HIV-1 replication. We identified 13 conserved regions in the gag RNA and constructed the corresponding Rzs. We transfected HEK293T cells with these Rzs and HIV-1 molecular clones. We identified one Rz that was particularly efficacious. We then constructed siRNAs and short hairpin (sh) RNAs targeting the same sequence. The shRNA was very active against HIV-1 clades B, C and A/G. Neither the Rz, nor the shRNA disturbs the cellular transcriptome, suggesting no toxicity. In lymphocytic cell lines, both the Rz and the shRNA inhibit long-term HIV-1 replication [ 2 ]. We identified new SOFA-HDV-Rz, siRNA and shRNA targeting HIV-1 Gag RNA. The shRNA is as active as the only shRNA that has advanced to clinical trials and targets more strains. Long-term inhibitory activity of these molecules shows that this site is particularly accessible to other antisense molecules. These molecules have a high potential to be used in combination gene therapy or as drugs with appropriate delivery methods.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».