MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2014995328 · doi:10.1016/j.femsle.2004.07.032

ComX activity of growing in biofilms

2004· article· en· W2014995328 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Letters · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial Research
Mots-clésBiofilmQuorum sensingBiologyReporter geneStreptococcus mutansTransformation (genetics)Shuttle vectorPopulationGeneExpression vectorGreen fluorescent proteinMicrobiologyGene expressionCell biologyBacteriaGeneticsRecombinant DNAVector (molecular biology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In many streptococci, including Streptococcus mutans, genetic competence is regulated by a quorum sensing system mediated by a competence stimulating peptide (CSP) pheromone, encoded by the comC gene. In Streptococcus pneumoniae, a central component of this system is ComX, which acts as an alternative sigma factor to activate competence genes involved in DNA uptake and processing. The quorum sensing system responsible for genetic competence induction in S. mutans has been linked to biofilm formation and the acid tolerance response. To examine the response of comX to CSP in S. mutans, a transcriptional fusion of the comX promoter (pcomX) with lacZ was constructed to generate reporter vector pcomx::pALH122 (replicative vector) and transformed into S. mutans UA159 comC-, which is unable to produce endogenous CSP. CSP was added and pcomX::lacZ relative expression index (REI) examined, revealing a 2-fold increase in maximal beta-gal activity 5 and 10 min after CSP addition. The effect of endogenous CSP on pcomX::lacZ expression was also examined by measuring REI in cells grown as a biofilm; peak pcomX activity was observed at 3 h. To determine the temporal pattern of transformation frequency, pMA2, a Spr shuttle vector, was transformed into biofilm-grown cells, with maximal transformation frequency observed at 3 h. Confocal microscopy was performed to examine pcomX activity using a similarly constructed green fluorescent protein reporter vector, pcomX::gfp, in a 4-h biofilm, revealing active pcomX activity in high cell density areas within the biofilm population. These results demonstrated a positive correlation between pcomX activity, natural transformation and competence development in biofilms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,604

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle