Regulation of nitrogenase in the photosynthetic bacterium <i>Rhodobacter sphaeroides</i> containing <i>draTG</i> and <i>nifHDK</i> genes from <i>Rhodobacter capsulatus</i>
Notice bibliographique
Résumé
The photosynthetic bacteria Rhodobacter capsulatus and Rhodospirillum rubrum regulate their nitrogenase activity by the reversible ADP-ribosylation of nitrogenase Fe-protein in response to ammonium addition or darkness. This regulation is mediated by two enzymes, dinitrogenase reductase ADP-ribosyl transferase (DRAT) and dinitrogenase reductase activating glycohydrolase (DRAG). Recently, we demonstrated that another photosynthetic bacterium, Rhodobacter sphaeroides, appears to have no draTG genes, and no evidence of Fe-protein ADP-ribosylation was found in this bacterium under a variety of growth and incubation conditions. Here we show that four different strains of Rba. sphaeroides are incapable of modifying Fe-protein, whereas four out of five Rba. capsulatus strains possess this ability. Introduction of Rba. capsulatus draTG and nifHDK (structural genes for nitrogenase proteins) into Rba. sphaeroides had no effect on in vivo nitrogenase activity and on nitrogenase switch-off by ammonium. However, transfer of draTG from Rba. capsulatus was sufficient to confer on Rba. sphaeroides the ability to reversibly modify the nitrogenase Fe-protein in response to either ammonium addition or darkness. These data suggest that Rba. sphaeroides, which lacks DRAT and DRAG, possesses all the elements necessary for the transduction of signals generated by ammonium or darkness to these proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».