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Enregistrement W2015272348 · doi:10.1073/pnas.0401591102

Heparan 2- <i>O</i> -sulfotransferase, <i>hst-2</i> , is essential for normal cell migration in <i>Caenorhabditis elegans</i>

2005· article· en· W2015272348 sur OpenAlexfundno aff
Tarja Kinnunen, Zebo Huang, Joanne Townsend, Michelle M. Gatdula, Jillian R. Brown, Jeffrey D. Esko, Jeremy E. Turnbull

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesMedical Research CouncilUniversity of California, IrvineNational Institutes of HealthSchool of Medicine, New York UniversityYork UniversityWellcome Trust
Mots-clésCaenorhabditis elegansHeparan sulfateSulfotransferaseBiologyMutantCell biologyProteoglycanPerlecanGeneMutationCellGeneticsBiochemistrySulfationExtracellular matrix

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The importance of heparan sulfate proteoglycans has been highlighted by a number of human genetic disorders associated with mutations in genes encoding for heparan sulfate proteoglycan protein cores or biosynthetic enzymes required for heparan sulfate (HS) assembly. To study the functional role of HS in Caenorhabditis elegans development cosmid sequence C34F6.4 was identified as the C. elegans ortholog of vertebrate heparan 2-O-sulfotransferase (HS2ST) and the gene named hst-2. HS2ST activity is present in C. elegans and is completely absent in a deletion mutant of hst-2, ok595, and specifically reduced by hst-2 RNA interference. Expression of hst-2 in CHO cells deficient in HS2ST rescues enzyme activity and binding of FGF2 to cell surface HS. hst-2 expression is found in the hypodermis, muscle, distal tip cells (DTCs), and in neurons. A null mutation in hst-2 causes cell migration defects. This work demonstrates sulfotransferase activity in C. elegans and indicates that specific 2-O-sulfate modifications are critical for normal HS functions in controlling cell migration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,395

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations84
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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