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Enregistrement W2015302779 · doi:10.4103/0255-0857.83916

Comparison between the two-step and the three-step algorithms for the detection of toxigenic Clostridium difficile

2011· article· en· W2015302779 sur OpenAlexfundno aff
M O Qutub, Nabeela AlBaz, Philip Hawken, A Anoos

Notice bibliographique

RevueIndian Journal of Medical Microbiology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissement
Mots-clésClostridium difficilePredictive valueClostridium difficile toxin AToxinGlutamate dehydrogenaseClostridiumClostridiaceaeMicrobiologyAlgorithmBiologyMedicineComputer scienceBacteriaAntibioticsInternal medicineGlutamate receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: To evaluate usefulness of applying either the two-step algorithm (Ag-EIAs and CCNA) or the three-step algorithm (all three assays) for better confirmation of toxigenic Clostridium difficile. The antigen enzyme immunoassays (Ag-EIAs) can accurately identify the glutamate dehydrogenase antigen of toxigenic and nontoxigenic Clostridium difficile. Therefore, it is used in combination with a toxin-detecting assay [cell line culture neutralization assay (CCNA), or the enzyme immunoassays for toxins A and B (TOX-A/BII EIA)] to provide specific evidence of Clostridium difficile-associated diarrhoea. MATERIALS AND METHODS: A total of 151 nonformed stool specimens were tested by Ag-EIAs, TOX-A/BII EIA, and CCNA. All tests were performed according to the manufacturer's instructions and the results of Ag-EIAs and TOX-A/BII EIA were read using a spectrophotometer at a wavelength of 450 nm. RESULTS: A total of 61 (40.7%), 38 (25.3%), and 52 (34.7%) specimens tested positive with Ag-EIA, TOX-A/BII EIA, and CCNA, respectively. Overall, the sensitivity, specificity, negative predictive value, and positive predictive value for Ag-EIA were 94%, 87%, 96.6%, and 80.3%, respectively. Whereas for TOX-A/BII EIA, the sensitivity, specificity, negative predictive value, and positive predictive value were 73.1%, 100%, 87.5%, and 100%, respectively. With the two-step algorithm, all 61 Ag-EIAs-positive cases required 2 days for confirmation. With the three-step algorithm, 37 (60.7%) cases were reported immediately, and the remaining 24 (39.3%) required further testing by CCNA. By applying the two-step algorithm, the workload and cost could be reduced by 28.2% compared with the three-step algorithm. CONCLUSIONS: The two-step algorithm is the most practical for accurately detecting toxigenic Clostridium difficile, but it is time-consuming.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,822
Score d'incertitude au seuil0,640

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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