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Enregistrement W2015384362 · doi:10.1002/pmic.201200455

Pilot study identifying myosin heavy chain 7, desmin, insulin‐like growth factor 7, and annexin <scp>A</scp> 2 as circulating biomarkers of human heart failure

2013· article· en· W2015384362 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePROTEOMICS · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSignaling Pathways in Disease
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of OttawaHeart and Stroke FoundationUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésDesminMyosinInsulin-like growth factorAnnexinGrowth factorAnnexin A2Heart failureAnnexin A5ChemistryMedicineInternal medicineBiochemistryImmunohistochemistryApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In-depth proteomic analyses offer a systematic way to investigate protein alterations in disease and, as such, can be a powerful tool for the identification of novel biomarkers. Here, we analyzed proteomic data from a transgenic mouse model with cardiac-specific overexpression of activated calcineurin (CnA), which results in severe cardiac hypertrophy. We applied statistically filtering and false discovery rate correction methods to identify 52 proteins that were significantly different in the CnA hearts compared to controls. Subsequent informatic analysis consisted of comparison of these 52 CnA proteins to another proteomic dataset of heart failure, three available independent microarray datasets, and correlation of their expression with the human plasma and urine proteome. Following this filtering strategy, four proteins passed these selection criteria, including myosin heavy chain 7, insulin-like growth factor-binding protein 7, annexin A2, and desmin. We assessed expression levels of these proteins in mouse plasma by immunoblotting, and observed significantly different levels of expression between healthy and failing mice for all four proteins. We verified antibody cross-reactivity by examining human cardiac explant tissue by immunoblotting. Finally, we assessed protein levels in plasma samples obtained from four unaffected and four heart failure patients and demonstrated that all four proteins increased between twofold and 150-fold in heart failure. We conclude that MYH7, IGFBP7, ANXA2, and DESM are all excellent candidate plasma biomarkers of heart failure in mouse and human.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle