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Enregistrement W2015397167 · doi:10.1021/bi702371e

Ion-Channel Formation Assisted by Electrostatic Interhelical Interactions in Covalently Dimerized Amphiphilic Helical Peptides

2008· article· en· W2015397167 sur OpenAlexaff
Junichi Taira, Masoud Jelokhani‐Niaraki, Satoshi Osada, Fumio Kato, Hiroaki Kodama

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensWilfrid Laurier University
Organismes subventionnairesNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology
Mots-clésAmphiphileChemistryCovalent bondIon channelBiophysicsElectrostaticsIonNanotechnologyMaterials scienceBiochemistryOrganic chemistryReceptorPolymerCopolymerBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An ultimate goal of synthetic ion-channel peptide design is to construct stable and functional ion-conducting pores. It is expected that specific interhelical interactions would facilitate the association of helices in phospholipid membranes and the successive helix-bundle formation. In the present study, we rationally designed helix-bundle ion channels using the synthetic hybrid peptide K20E20, a disulfide dimer of cationic- and anionic-amphiphilic helices Ac-CGG-(BKBA) 5-NH 2 and Ac-CGG-(BEBA) 5-NH 2. Circular dichroism (CD) measurements in aqueous media implied helix stabilization in the peptide caused by the interhelical electrostatic interactions. In addition, CD spectra recorded in the presence of DPPC liposomes and dye-leakage measurements suggested a high degree of association of peptide monomers in phospholipid membranes as well as high affinities between peptide and lipid bilayers. These features allowed ion-channel formation at extremely low peptide concentrations (as low as 1 nM). According to electrophysiological analyses, stable helix bundles were constructed of six peptide helices by association of three K20E20 molecules. Helix-helix association in lipid membranes, peptide-membrane interactions, and ion-channel formation of K20E20 peptides were all facilitated by intramolecular electrostatic interactions between the helices of the hybrid peptide and were pH-dependent. Conductance through K20E20 ion channels decreased under acidic conditions because of the interruption of the salt bridges.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,817

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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