C4orf41 and TTC-15 are mammalian TRAPP components with a role at an early stage in ER-to-Golgi trafficking
Notice bibliographique
Résumé
TRAPP is a multisubunit tethering complex implicated in multiple vesicle trafficking steps in Saccharomyces cerevisiae and conserved throughout eukarya, including humans. Here we confirm the role of TRAPPC2L as a stable component of mammalian TRAPP and report the identification of four novel components of the complex: C4orf41, TTC-15, KIAA1012, and Bet3L. Two of the components, KIAA1012 and Bet3L, are mammalian homologues of Trs85p and Bet3p, respectively. The remaining two novel TRAPP components, C4orf41 and TTC-15, have no homologues in S. cerevisiae. With this work, human homologues of all the S. cerevisiae TRAPP proteins, with the exception of the Saccharomycotina-specific subunit Trs65p, have now been reported. Through a multidisciplinary approach, we demonstrate that the novel proteins are bona fide components of human TRAPP and implicate C4orf41 and TTC-15 (which we call TRAPPC11 and TRAPPC12, respectively) in ER-to-Golgi trafficking at a very early stage. We further present a binary interaction map for all known mammalian TRAPP components and evidence that TRAPP oligomerizes. Our data are consistent with the absence of a TRAPP I-equivalent complex in mammalian cells, suggesting that the fundamental unit of mammalian TRAPP is distinct from that characterized in S. cerevisiae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».